《最后的生还者2》的剧情自发售以来一直争议不断，主要因为游戏中艾比杀死了乔尔并且艾莉一心想复仇，但又放过了艾比，让许多玩家感到不满。而在最近的推出重制版中加入了开发者解说，透露了一个完全不同结局。

　　据制作人尼尔·德鲁克曼表示，在游戏早期的草稿中，艾莉在游戏结束时会杀死艾比。在这个版本的剧情中，列夫和叶拉都已经死亡，只有艾比一个人存活。尼尔解释说，乔尔并不希望艾莉杀死艾比。这是因为乔尔自己杀了很多人，所以他知道自己的死是难以逃避的。

　　游戏编剧哈雷·格罗斯表示，我认为艾莉身上还有3%的人性，而这些人性都是乔尔帮她塑造的。如果艾莉杀了艾比，她的纯真和人性就将彻底消失，变成一个怪物。而如果不杀艾比，这就给了玩家一丝希望，艾莉还有机会重新获得新生。